荷兰团队揭开第一个郁金香基因组
荷兰 - 德莱尔/莱顿,当地时间2017年10月31日 – 由荷兰三个领先组织BaseClear,Generade和橙色多盟的团队宣布对郁金香DNA序列研发取得重大进展。
荷兰 - 德莱尔/莱顿,当地时间2017年10月31日 – 由荷兰三个领先组织BaseClear,Generade和橙色多盟的团队宣布对郁金香DNA序列研发取得重大进展。该联盟自2017年5月起合作,目的是能使郁金香生产和繁殖更快,更可持续的进行。日前可以公布的第一个重大结果是:使用最新技术,现在可以确定郁金香基因组的DNA序列。 这是有史以来最大的基因组之一:世界首演,起源于荷兰莱顿市。 在Hortus植物园的步行距离内,第一个郁金香种球由卡罗尔斯克鲁西斯在十六世纪末期种植,为这个荷兰的象征奠定了文化基础。 而此次的测序成果将会公开,以便获得的知识得到全人类的充分利用。
郁金香基因组包含大量相同的DNA,其不断自我复制。 通过以完整的形式分离这些板块并借助DNA测序技术读取,使得末端具有独特的DNA序列,可以使用强大的生物信息学工具绘制整个基因组。
该联盟近几个月来使用了Oxford Nanopore Technologies公司的基因组测序仪和Generade和Future Genomics Technologies开发的TULIP算法。 经研发现,非常普通的花园用郁金香具有一个独特的特征,其DNA序列是经过测序以来的最大的基因组。 其大小约为34千兆碱基对,是人类的11倍。 而在接下来的几个月中,郁金香品种Orange Sherpa的DNA将被反复排序,以提供更好的研发方案,数十亿的DNA序列将借助TULIP技术被拼接在一起。
郁金香基因组揭示了DNA如何决定郁金香的特性。 与需求特性相关的DNA序列将很快被用于高级育种,以便将这些特性组合起来以产生新的优化品种。 有了这项技术,可以更快更有针对性地研发耐病的新型郁金香种球。 这也将减少植物后期维护成本。
橙色多盟研究与开发总监Hans van den Heuvel:“人类的基因组在郁金香的基因组规模面前显得十分渺小:人类的整个基因组只相当于一个郁金香染色体,这是一项跨世纪的技术,这项工作已经花了100多年,简直就是一个不可能完成的任务,但现在,我们可以在几天内完成数据分析,而且毫无疑问,它将产生大量有效数据,这将会颠覆整个郁金香育种行业,使这项工作之更快,更具预测性,当然,最重要的是“更环保”,因为我们更重点关注可持续性的品种。
总经理Helma Kaptein:“这个基因组成果将公开于众,它象征了郁金香行业创新的第一步,这个行业正面临社会和经济挑战,郁金香在荷兰文化和象征方面都非常珍贵,公私合作将能够实现传统农业的可持续创新发展。
BaseClear是荷兰最大的独立DNA分析实验室。 BaseClear首席执行官Bas Reichert概述了他对这个项目的承诺:“这个项目已经展示了最新的DNA技术在观赏园艺领域的影响和适用性,证明这种技术现在是可行和可负担的,使用DNA技术将进一步加快观赏行业的发展,使其更加长远,我们为此与自己的合作伙伴感到自豪,我们可以通过这种方式为更环保的世界做出贡献。
公司简介
Generade
Generade是莱顿的专业基因组学中心。 在Generade,包含生物技术公司BaseClear,莱顿应用科技大学,莱顿大学医学中心(LUMC),Naturalis生物多样性中心和莱顿大学联合推动最佳,应用教育研究和创业。
BaseClear
BaseClear是DNA研究领域的实验室独立机构。 BaseClear 内65个强大的团队热衷致力于从Leiden Bioscience Park实验室开发DNA技术。该技术适用于全球范围内从食品和制药行业到植物育种的许多行业的BaseClear客户的合同研究。 创新和质量是该专业实验室提供服务的首要任务。 在创新方面,BaseClear与许多合作伙伴知识分享; 质量保证符合ISO和GMP质量标准
橙色多盟
橙色多盟是一家领先的切花,球茎,多肉植物,盆栽植物,花坛植物和多年生植物育种和开发的公司。 其年营业额约2.6亿欧元。 该公司在全球拥有7000多名员工。 除了庞大的营销和销售网络,橙色多盟拥有强大的生产网点。 橙色多盟的成功关键在于广泛而深入的产品系列,并得到全球供应链的支持。 公司勇于承担社会责任,投资于员工的健康,安全和个人发展。
更多信息:
Helma Kaptein – Generade总裁
kaptein@generade.nl / +31(0)6 39 11 50 48
Bas Reichert - CEO BaseClear
bas.reichert@baseclear.com / +31(0)71 52 33 917
Marco van der Sar –橙色多盟营销和企业推广经理
m.vandersar@dummenorange.com / +31 (0)6 23 20 84 77